Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc33Q3ULW6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc33Q3ULW6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms