Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Nkx6-3Q3UHX8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Nkx6-3Q3UHX8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Nkx6-3Q3UHX8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Nkx6-3Q3UHX8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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