Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trafd1Q3UDK1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms