Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Rnf180Q3U827 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf180Q3U827 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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