Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf149Q3U2C5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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