Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc174Q3U155 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc174Q3U155 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms