Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmtk2Q3TYD6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms