Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shcbp1lQ3TTP0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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