Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdnep1Q3TP92 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms