Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp39Q3TIX9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms