Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc13Q3TIR1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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