Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Defa26Q3L180 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms