Protein–RNA interactions for Protein: Q2WG77

Ripply1, Protein ripply1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply1Q2WG77 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ripply1Q2WG77 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms