Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm1123Q1RME4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm1123Q1RME4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms