Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmntd2Q0VET5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms