Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rundc1Q0VDN7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rundc1Q0VDN7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms