Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pglyrp4Q0VB07 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms