Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spata18Q0P557 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spata18Q0P557 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms