Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TrioQ0KL02 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms