Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NeblQ0II04 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms