Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms