Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf541Q0GGX2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms