Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnma1Q08460 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnma1Q08460 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms