Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Calb2Q08331 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms