Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NrepQ07475 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms