Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Siah1bQ06985 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms