Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdr16c6Q05A13 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms