Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top1Q04750 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms