Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms