Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnd1Q03719 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnd1Q03719 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms