Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnb1Q03717 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms