Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tff2Q03404 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms