Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nucb1Q02819 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nucb1Q02819 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms