Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms