Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EgfrQ01279 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms