Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col1a2Q01149 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms