Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde1bQ01065 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms