Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrcdQ00LT2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms