Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbp4Q00724 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms