Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeleQ00690 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms