Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Apoa1Q00623 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms