Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Il6stQ00560 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms