Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb4P99026 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psmb4P99026 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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