Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cry1P97784 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms