Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkaP97477 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkaP97477 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkaP97477 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AurkaP97477 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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AurkaP97477 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AurkaP97477 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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AurkaP97477 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AurkaP97477 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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AurkaP97477 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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AurkaP97477 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AurkaP97477 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms