Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec1P97353 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec1P97353 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec1P97353 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec1P97353 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec1P97353 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec1P97353 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec1P97353 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec1P97353 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec1P97353 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec1P97353 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms