Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp1P97350 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms