Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim43bP86448 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim43bP86448 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim43bP86448 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim43bP86448 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim43bP86448 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim43bP86448 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim43bP86448 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim43bP86448 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim43bP86448 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim43bP86448 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim43bP86448 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim43bP86448 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim43bP86448 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim43bP86448 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms