Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H3f3aP84244 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H3f3aP84244 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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