Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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